什么PCR与DNA测序和扩增基因有关
聚合酶链式反应( PCR )是一种用于制备多个基因拷贝的分子遗传技术,也是基因测序过程的一部分。
聚合酶链式反应如何工作?
使用DNA样本制作基因拷贝,该技术足以从样本中发现的单个基因拷贝中制作多份拷贝。 对基因进行PCR扩增以产生数百万个拷贝,允许使用基于DNA片段的大小和电荷(+或 - )的视觉技术来检测和鉴定基因序列。
在受控条件下,DNA的小片段由称为DNA聚合酶的酶产生,其将免疫脱氧核苷酸(dNTP)添加到被称为“模板”的DNA片段中。 甚至更小的DNA片段,被称为“引物”被用作聚合酶的起点。 引物是小的人造DNA片段(寡聚体),通常长度在15到30个核苷酸之间。 它们是通过了解或猜测被扩增基因末端的短DNA序列而制成的。 在PCR期间,被测序的DNA被加热并且双链分开。 冷却后,引物与模板结合(称为退火)并为聚合酶开始创造位置。
PCR技术
通过发现嗜热菌和嗜热聚合酶(在高温加热后保持结构完整性和功能性的酶),聚合酶链式反应(PCR)成为可能。
涉及PCR技术的步骤如下:
- 创建一个混合物,优化浓度的DNA模板,聚合酶,引物和dNTPs。 在不变性酶的情况下加热混合物的能力允许在94摄氏度范围内的温度下使DNA样品的双螺旋变性。
- 变性后,将样品冷却至约54度的更温和的范围,这有利于引物与单链DNA模板的退火(结合)。
- 在循环的第三步中,将样品重新加热至72度,这是Taq DNA聚合酶理想的延伸温度。 在延伸期间,DNA聚合酶使用原始DNA单链作为模板向每个引物的3'末端添加互补的dNTP,并在感兴趣的基因区域产生一段双链DNA。
- 退火至不完全匹配的DNA序列的引物不会在72度退火,因此限制了目标基因的延伸。
变性,退火和延伸的过程重复多次(30-40次),从而指数地增加混合物中所需基因的拷贝数。 尽管如果手动进行该过程将是非常繁琐的,但是样品可以在可编程热循环仪中制备并孵育,现在在大多数分子实验室中很常见,并且可以在3-4小时内进行完整的PCR反应。
每个变性步骤终止前一个循环的延伸过程,从而截断DNA的新链并将其保持为大约所需基因的大小。
取决于感兴趣的基因的大小,延伸周期的持续时间可以变得更长或更短,但是最终,通过重复的PCR循环,大部分模板将仅限于感兴趣基因的大小,因为它们将从两种引物的产物产生。
成功的PCR有几个不同的因素 ,可以通过操纵来提高结果。 测试PCR产物存在的最广泛使用的方法是琼脂糖凝胶电泳 。 用于根据大小和电荷分离DNA片段。 然后使用染料或放射性同位素使片段可视化。
进化
自发现PCR以来,已发现除原始Taq以外的DNA聚合酶。 其中一些具有更好的“校对”能力或在较高温度下更稳定,因此提高了PCR的特异性并减少了插入不正确dNTP的错误。
PCR的一些变体已经被设计用于特定的应用,现在在分子遗传实验室中经常使用。 其中一些是实时PCR和逆转录酶PCR。 PCR的发现还导致DNA测序, DNA指纹分析和其他分子技术的发展。